پژوهشکده‌های دارای موافقت قطعی
- پژوهشکده مطالعات و تحقیقات حمل و نقل (تلفن تماس: 66164185)
- پژوهشکده مخابرات نظری
- پژوهشکده الکترونیک
- پژوهشکده علوم و فناوری انرژی
- پژوهشکده علوم و فناوری نانو
- پژوهشکده سیاست گذاری علم صنعت و فناوری
پژوهشکده‌های دارای موافقت اصولی
- پژوهشکده زیست فناوری و محیط زیست (تلفن تماس:66164104- 66164101)
- پژوهشکده توسعه علوم و فناوری فضا
- پژوهشکده مطالعات اقتصادی و صنعتی شریف
- پژوهشکده شهید رضائی
پژوهشکده‌های دارای موافقت شورای پژوهشی دانشگاه
پژوهشکده‌های تقاضا محور (ستادی)
- پژوهشکده شهید نیلی
- پژوهشکده علوم و فناوری شهید احمد کاظمی
- پژوهشکده تهرانی مقدم (تلفن: 66166039)
- پژوهشکده بالا دستی نفت شریف